可以说，项目管理是面向项目目标的管理，而部门管理是面向职能的机构管理。

项目管理主要是负责合理地组织资源(人力、信息沟通)，保质(质量)保量(范围)按时(时间)经济地(成本)完成合同目标(采购管理)。

部门是根据公司的业务范围，按专业或阶段化划分的组织单位，主要负责公司战略目标的局部实现，包括人员日常管理(考核、培养、晋升等)、各项目之间的资源调配、市场开拓、利润核算等。

至于专业管理，这是一种手段，项目管理和部门管理中都需要专业管理。项目管理需要不同专业之间的配合，如果专业力量出现不足，常常需要到相应部门调配资源(涉及到该部门的管理)，或从公司外部选聘专业能力。同样地，部门管理也应该按专业分工进行管理。