一、征税率与退税率的大小
一般情况下，增值税的征税率比退税率高，征退税差额要计入出口货物成本。在进料加工贸易方式下，征、退两个比率差异越大，不予免征的税额就越大，也就是要算入成本的数额就越大。
【例】某有进出口经营权的出口企业为国外加工一批货物，进口保税料件价格为2000万元，加工后出口价格为3500万元，为加工产品所耗用的国内原材料等费用的进项税为70万元，增值税适用税率为17%，出口退税率为13%.假设货物全部出口。
（1）企业采用来料加工贸易方式：因来料加工贸易方式下，企业进口和出口货物都是免税的，企业不用交纳增值税税款。
（2）企业采用进料加工贸易方式，计算税额如下：
当期免抵退税不予免征和抵扣税额=(3500-2000)×(17%-13%)=60万元
当期应纳税额=60-70=-10万元
也就是说，在上面的假设条件下，如果采用进料加工贸易方式，企业能得到10万的增值税退税。
但是，如果将出口退税率改为11%。那么：
当期免抵退税不予免征和抵扣税额=(3500-2000)×(17%-11%)=90万元
当期应纳税额=90-70=20（万元）
点评：可以看出，征税率与退税率的差越大，当期免抵退税不予免征和抵扣税额就越大，也就是出口货物成本的数额就越大。

二、耗用国产料件的数量
因来料加工方式不同，国产料件的进项税额可以进行抵减，在很大程度上决定企业能否退税，从而左右加工贸易方式的选择。
延用上例，如果将国内原材料等费用的进项税改为50万元，则情况又有所改变：
当期免抵退税不予免征和抵扣税额=(3500-2000)×(17%-13%)=60（万元）
当期应纳税额=60-50=10（万元）
点评：当国内采购料件少，也就是进项税额低时，若采用进料加工贸易方式，可抵减的进项根本不足以抵减销项税，因此要交纳税额，故应选择来料加工方式。

相反，在出口货物耗用的国产料件多的情况下，进项税额相应较大，若选择来料加工贸易方式，因为不能办理退税，进项税额越大，就会存在出口成本随着国产料件的增加而增大的现象。进料加工贸易方式下，抵减额可以办理出口退税，其业务成本就会等于或者小于来料加工贸易方式的成本。故应选择进料加工方式。

三、企业利润水平的高低
企业利润的高低也会对交税有影响。进料加工贸易方式下，利润越大，当期免抵退税不得免征和抵扣的税额就会更大，那么，当期应退税额就会变少，甚至要交纳税额。如果利润少的话，当期免抵退税不得免征和抵扣的税额也会小，退税会多一点。
延用前例的相关数据，如果出口价格改为4000万元，利润增大，应纳税额发生改变：
当期免抵退税不予免征和抵扣税额=(4000-2000)×(17%－13%)=80（万元）
当期应纳税额=80-70=10（万元）
点评：也就是说，在上面的假设条件下，如果采用进料加工贸易方式，企业要交纳10万的增值税，而采用来料加工则可以省下10万增值税。

因此，生产企业根据材料采购、生产、货物销售（出口和内销）等具体情况，综合考虑上面的3种因素，合理调整内外销比例，使税收负担减到最低，将有助于生产企业减轻增值税负或节省出口货物成本。