二、不同之处
1、软件二次开发是在现有成熟的产品或系统的基础上进行的开发，一般是现有产品或系统不能满足客户的需求，需要进行个性化的补充开发。这种开发需要充分理解现有系统的功能、技术架构和设计，一般由原有软件系统的开发厂商来继续开发或处理。开发的时间和成本与现有软件系统的成熟度、扩展性及最终用户的需求息息相关。
2、软件二次开发必须遵循原有软件系统的设计和技术框架（系统间的接口开发除外）。
3、软件定制开发可能是全新的开发，可以使用开发框架或定制开发平台进行开发，需要充分理解业务需求，需要有软件项目定制开发经验的团队。
4、软件二次开发从时间和成本上低于完全的定制开发。

三、二者之间的联系
1、全新定制开发的系统系统正式运行后，如果最终用户后续有新的需求需要通过二次开发实现。
2、二次开发的工作量比较大、和现有系统关联比较少，实际上等同于一个全新的定制开发。
转自：http://www.chysoft.net/files/article_597.htm